Варианты сборок Windows Mobile 6 оптимизированы для простоты, гибкости, и модульности, встроенных в Windows Mobile устройств. Существует три основные сборки - Windows Mobile 6 Classic, Windows Mobile 6 Standart, и Windows Mobile 6 Professional. В дополнение к стандартным особенностям, доступным в каждой версии, каждая сборка также содержит дополнительные лицензируемые компоненты, чтобы предоставить дополнительные функциональные возможности пользователям и обеспечить дифференцирование среди Windows Mobile устройств.